وجد السكن الداخلي لتحقيق رسالة العملية التعليمية بتوفير المناخ المناسب لسكن الطلاب المقبولين في الثانويات النموذجية من المديريات البعيدة عن المكلا وسيئون ، والاسهام في تكوين شخصية الطلاب، ورعايتهم في الجوانب النفسية والاجتماعية والصحية، والسعي لتمكينهم من زيادة التحصيل العلمي من خلال تهيئة الجو الملائم للطلاب حتى يتمكن الطالب من التفرغ للدراسة والتحصيل العلمي العالي تحت إشراف إدارة التعليم العام بالمؤسسة.
كما يساعد السكن الداخلي على تعديل سلوك الطلاب وعدم الاختلاط بأصدقاء السوء، نظراً لوجود بيئة تنظيمية يشرف عليها متخصصون في هذا المجال.

ويعد السكن الداخلي أحد العوامل الرئيسية المؤثرة إيجابياً في حياة الطالب. وذلك للدور الكبير الذي تقوم به المؤسسة ممثلة في إدارة التعليم العام، والتي سعت إلى إيجاد وتوفير بيئة تنظيمية اجتماعية تعليمية ثقافية ورياضية، تتيح للطالب الكثير من الفرص لتنمية قدراته وإظهار مهاراته وتلبية حاجاته.

ويعتبر مبنيي السكن الداخلي في المكلا وسيئون من أرقى السكنات الطلابية في البلاد عموماً ومحافظة حضرموت خصوصاً من حيث الجودة والتنفيذ وتكامل الخدمات المتوفرة بهما. ويتكون كل سكن من أدوار مكتملة الخدمات والتجهيزات من شقق مؤثثة ومجهزة بالمستلزمات الضرورية كافة.

ويتم في بداية كل عام دراسي جديد استقبال الطلاب المقبولين للدراسة في الثانويات النموذجية (الصف الأول) والذين هم من خارج مديريتي المكلا وسيئون، حيث يقوم الطلاب المقبولين بتعبئة استمارة طلب الاقامة في السكن الداخلي وتوقيع الطالب وولي أمره على استمارة التعهد والالتزام والاطلاع على اللائحة والالتزام بها.

وتشرف إدارة التعليم العام بالمؤسسة على سير تنفيذ الأنشطة والفعاليات (الثقافية، الاجتماعية، الرياضية، ...) الخاصة بالطلاب من أنشطة لاصفية وبرامج لطلاب السكن - في داخل السكن وخارجه - من محاضرات تنموية وتوعية ومسابقات رياضية ورحلات وجلسات وزيارات وغيرها وذلك عبر مشرفي السكن واللجان الطلابية.

ويقدم السكن الداخلي بالثانويتين الخدمات المجانية الآتية للطلاب :

• وجود مشرفين وحراس أمن على مدار الساعة
• خدمات المبيت (الاسرّة والمخدات والاغطية) وتجهيز أثاث الغرف وبنوعية حديثة وجيدة جدا وتتلاءم مع سكن الطلاب.
• خدمات الطعام والشراب (تقديم ثلاث وجبات طعام يومياً داخل السكن).
• توفير الاسعافات الأولية واسعاف الحالات الطارئة الى المستشفى وتقديم العلاج المجاني.
• خدمات غسيل الملابس (يوجد في السكن غسالات كهربائية لغسيل ملابس).
• تجهيز قاعات مشاهدة للتلفاز.
• توفير متخصص للقيام بأعمال الصيانة المطلوبة.
• توفير عاملات نظافة للمحافظة على نظافة وصحة المكان.
• توفير باصات لنقل الطلاب من السكن الى الثانوية والعكس.