تأسس السكن الداخلي في المكلا مع إنشاء ثانوية المكلا النموذجية للبنين في العام الدراسي 2007-2008م، ويقع حالياً في منطقة خلف في قصر الشيخ المهندس/ عبدالله أحمد بقشان، ويتكون من ثلاثة أدوار ويضم (30) غرفة مؤثثة ومجهزة بالمستلزمات الضرورية + صالة طعام + صالة رياضية + مكتب مشرف السكن.