افتتح المعهد بالمكلا يوم الأثنين 26 ذو الحجة 1427هـ الموافق 15/01/2007م في حين افتتح المعهد بسيئون في 26/02/2008م.

قبل أوائل محافظة حضرموت في الثانوية العامة والمعاهد على مستوى الجمهورية للدراسة في المعهدين (مجاناً) ، وتخفض الرسوم لذوي النسب العالية (90%) وما فوق ، وبرسوم رمزية للدارسين الآخرين من الطلاب ومن غيرهم ، ويعفى من الرسوم الدراسية او تخفض كل من تحصل على امتياز في مستويات المعهد الدراسية المختلفة.

خلال الفترة المنصرمة نظم المعهد برامج مختلفة ومنها البرنامج العام للدورات العامة من المستويات الابتدائية إلى الإعدادية فالمتوسطة حتى المتقدمة. وقد وصل عدد هذه الدورات حتى الآن (58) دورة دراسية.

وفيما يتعلق ببرنامج التوفل (TOEFL) نظم المعهد عشر دورات لتحضير التوفل المحلي (ITP) والدولي

(iBT - BPT) وبلغ عدد الخريجين (137) طالباً وطالبة ، وتقام حالياً دورة لتحضير التوفل المحلي لطلبة ماجستير طب المجتمع والأسرة. وبلغ عددهم (27) طالباً وطالبة. وفي اطار التنسيق مع معهد "الاميدست" باعتماد معهد حضرموت مركزاً لاختبارات التوفل المحلي. أستقبل المعهد (97) طالباً وطالبة خلال أربع دورات امتحانيه وقد تحصل الكثير منهم على الدرجات المطلوبة.

اضافةً إلى ذلك ينظم معهد حضرموت دورات الإنجليزية لطلبة الطب ودورات المحادثة. وفي اطار التدريب والتأهيل أقام المعهد ، وبخبرات محلية، دورتين حول طرائق التدريس في اللغة الإنجليزية لكل من مدرسي الثانوية النموذجية في المكلا وسيئون وذلك ضمن خطة تطوير التعليم العام.

وسيتم استقطاب عدد من خريجي الجامعات المتميزين لابتعاثهم للدراسة العليا والتأهيل المهني في الولايات المتحدة الأمريكية للحصول على مؤهلات تمكنهم من دعم هيئات التدريس بالمعاهد التابعة للمؤسسة وبالثانويات النموذجية. كما يسعى معهد حضرموت إلى نسج علاقات أكاديمية مع معاهد مناظره داخل الجمهورية وخارجها. وقد تمثل ذلك في اقامة تنسيق مع (دار المصطفى) بتريم بترتيب زيارات مستمرة للطلبة الأجانب بدار المصطفى للمدارس النموذجية ومعهد حضرموت بسيئون وعقد لقاءات مع الطلبة هناك لتطوير مهارات الطلبة اللغوية وخاصة في مجال المحادثة. جاء هذا عقب زيارات قام بها كل من المدير العام التنفيذي للمؤسسة الدكتور صالح عوض عرم و الأستاذ أمين باعباد (نائب المدير العام التنفيذي) ومدير المعهد الأستاذ أحمد بن مخاشن ومدير معهد سيئون الأستاذ علوي بن طاهر.

ويسعى معهد حضرموت للوصول للاعتماد الأكاديمي للمعهد بربط شهادات المعهد بالمعيار الأوروبي العالمي للغات (Common European Frame Work ). وأيضاً فان إدارة المعهد على تواصل مستمر مع الهيئة العالمية (E.T.S) لمنح درجة الكفاءة (التوفل) لاعتماد معهد حضرموت مركزاً رسمياً لامتحانات التوفل المحلية والدولية. وحسب المعايير الدولية المطلوبة يستطيع المعهد ان يوفر هذه المعايير.

واشير هنا أيضاً ان معهد حضرموت للغة الإنجليزية يقوم بالإشراف الاكاديمي لبرنامج الاعداد للتوفل في المدارس النموذجية في كل من المكلا وسيئون.